現任領導
-
李家彪 所長、黨委書記
李家彪，中共黨員，中國工程院院士。主持黨委、行政事業全面工作，負責審計工作。
分管辦公室 -
鄭玉龍 副所長
鄭玉龍，無黨派人士，碩士，工程技術帶頭人，碩士生導師。負責科技開發、財務、地方合作、業務部門等方面工作。
分管開發處、財務處、各實驗室（中心、院）、浙江省海洋科學院 -
王小波 紀委書記
王小波，中共黨員，大學，工程技術帶頭人。負責紀檢工作。
分管紀委辦公室 -
梅顯俊 黨委副書記
梅顯俊，中共黨員，碩士，高級工程師。負責黨建、人事、后勤、工會、老干部、安全保密等方面工作。
分管黨委辦公室、人事處 -
方銀霞 副所長
方銀霞，中共黨員，博士，研究員，萬人計劃創新領軍人才。
負責科技業務、基建裝備、船舶管理、軍民合作等方面工作。
分管業務處、基建裝備處、船舶運管中心 -
陳建芳 副所長
陳建芳，中共黨員，博士，研究員，博士生導師。
負責科技平臺、學科建設、國際合作、研究生教育、基地建設等方面工作。
分管科技處、研究生教育中心、科技保障中心、極地深海技術研究院
